图片
导读:EB病毒(EBV)相关胃癌(GC)进展出有趣的免疫调治反映。然则,EBV压印肿瘤免疫和调治反映的细胞基础仍不解确。
近日,中山大学徐瑞华及澳门大学张海燕共同通信在《Signal Transduction and Targeted Therapy》(IF=39)在线发表题为“Dynamic single-cell mapping unveils Epstein-Barr virus-imprinted T-cell exhaustion and on-treatment response”的盘问论文,该盘问通过纵向scRNA-seq和配对scTCR/BCR-seq综合表征了免疫化疗调治东说念主EBV (+) GC的动态肿瘤免疫环境。
图片
盘问配景
01
胃癌(GC)仍然是癌症相关耗损的主要原因,在大家鸿沟内,终点是在东亚,胃癌患病率很高。在往时十年中,免疫查验点阻难剂(ICIs)的引入为多样类型的癌症的调治门径带来了紧要动荡。然则,PD-1/PD-L1通路阻断算作单一疗法的临床有用性仅在约10%的胃癌(GC)患者中不雅察到,在化疗中添加抗PD-1 / PD-L1抗体在先前未经调治的晚期胃癌(GC)患者中显现出与单独化疗比较的更好疗效。因此,这种组合被淡薄算作GC患者的新次第一线调治。尽管有这种有但愿的临床进展,但唯唯独小部分GC患者可能从免疫化疗中得回执久的益处。因此,仍然紧迫需要细目展望临床反映的生物标志物。在这方面,现在正在评估爱泼斯坦巴尔病毒(EBV)阳性,似乎很有但愿。
EBV(+)GC是由癌症基因组图谱(TCGA)盘问蚁集细看法一个不同子集。越来越多的数据,包括咱们团队的前瞻性临床西宾,标明EBV(+)GC中的ORR至PD-1阻难剂比EBV (−) GC高~25%。尽管在显露EBV(+)GC的临床特征方面取得了紧要进展,但相关病毒-宿主免疫互相作用偏执特有特征的环节问题仍然存在。显露EBV(+)GC中对免疫调治的超敏反映,对显露所波及的特定免疫反映至关环节。
晚期EBV(+)GC和EBV(−)GC的特有单细胞免疫景不雅
02
在施行主因素分析(PCA)或使用均匀流形访佛和投影(UMAP)可视化数据之前,咱们领先兼并并归一化了整个样品,以构建患者之间的参考细胞图谱。这么作念是为了沟通转录谱中的任何批次效应。经由数据预经管和质料截止,咱们将免疫细胞分为六个主要簇:T细胞,NK细胞,B细胞,浆细胞,骨髓细胞和肥硕细胞(图1d)。细胞的聚类由已设置的标志基因的共同抒发特征决定(图1e)。每个单独的样本为整个细胞亚群孝顺了代表性细胞。批量效应的影响很小。
图片
EBV(+)GC和EBV(−)GC 之间的径直比较显现,前者具有更发炎的免疫表型,其中 T 细胞和 B 细胞浸润更多。EBV(−)GC显现免疫阻难肿瘤微环境(TME),浆细胞,骨髓细胞和肥硕细胞富集(图1f)。两组B细胞和浆细胞均显贵增多,而髓系细胞在集聚调治后均呈下落趋势,标明主要免疫细胞类型发灵活态变化。T细胞是与调治反映相关的主要免疫细胞簇。通过查验整个T细胞(n = 48,070)中配对的TCRα和TCRβ库,咱们发现EBV(+)GC中61.48-73.12%的T细胞含有至少一个出产性TCRα或β链;EBV(−)GC中35.30–70.43%的T细胞具有多个克隆型。此外,EBV(+)GC中13.50-33.41%的T细胞过度扩增(100
盘问后果
快播在线观看03
最近单细胞RNA测序(scRNAseq)在肿瘤微环境盘问中的诈欺为浸润肿瘤的免疫细胞的生物学提供了有价值的视力此外ai换脸 porn,破译浸润T/B细胞的精准TCR/BCR克隆型增强了东说念主们对符合性免疫反映的显露,并为细目潜在的调治靶点提供了有价值的视力。在这项盘问中,作家使用scRNA-seq和单细胞TCR/BCR测序期间,表征了EBV(+)和EBV (-) GC患者在免疫化疗前后的动态肿瘤免疫环境。通过盘问免疫化疗耐药和敏锐性的潜在机制,不错发现对调治有反映的特定免疫细胞亚型。该盘问花式了EBV压印调治T细胞免疫在GC中的特有含义,这不错用于优化精准免疫调治的合理狡计。
本站仅提供存储处事,整个实质均由用户发布,如发现存害或侵权实质,请点击举报。